Plusieurs interventions archéologiques, réalisées entre 1980 et 2009, ont précédé les travaux de restauration architecturale et d’aménagement des lieux. Des études paléoanthropologiques ont permis d’observer certains rites funéraires des communautés anglicane et presbytérienne de Québec et de se pencher sur l’état de santé de cette partie de la population.